（一）以农业主产区特别是粮食主产区为重点
　　农业主产区是指农业生产在全国占有重要地位，能够提供较多粮、棉、油、肉、糖等关系国计民生的大宗农产品的集中产区。我国农业发展和粮食安全主要靠农业主产区支撑。农业综合开发以农业主产区特别是粮食主产区为重点，有利于提高全国农业综合生产能力，保证主要农产品的有效供给，增加农业主产区农民的收入。
　　1、进一步界定农业主产区及粮食主产区的范围。依据各地主要农产品的产量等主要指标，并参考有关部门的界定办法与范围，确定黑龙江（含省农垦总局）、吉林、辽宁（不含大连）、内蒙古、河北、河南、山东（不含青岛）、江苏、安徽、四川、湖南、湖北、江西、新疆、广西、云南、新疆生产建设兵团等17个省级单位作为农业综合开发的农业主产区，其中前13个省级单位为粮食主产区，新疆、新疆生产建设兵团为棉花主产区，广西、云南为糖料主产区。各省（区、市）要根据本地实际情况，研究确定重点开发的市、县。
　　2、进一步明确农业主产区特别是粮食主产区农业综合开发的任务。农业综合开发以中低产田改造为重点，特别是要加强基本农田保护区范围内的中低产田改造，着力加强农业基础设施建设，改善农业生产条件和生态环境，建设优质、高产、稳产、节水、高效农田，增强农业抗御自然灾害的能力，坚定不移地提高农业综合生产能力特别是粮食生产能力，保证国家粮食安全。以市场为导向，发挥农业区域比较优势，积极培育和壮大优势特色产业，大力扶持辐射带动作用强的产业化龙头企业和与农民建立起紧密的利益联结机制的专业合作经济组织，积极推进产业化经营，促进农业和农村经济结构的战略性调整，提高农业的综合效益，不断增加主产区农民特别是种粮农民的收入。
　　（二）以农产品优势产区为重点，积极支持优势农产品产业带建设
　　1、优势区域的农业综合开发项目县，要参照《优势农产品区域布局规划》确定本地的优势农产品和产业，紧紧围绕优势农产品产业带建设统筹安排农业综合开发项目。重点扶持优势区域内农业基础设施建设，为发展优势农产品生产提供条件。对位于优势区域内项目县申报的农业综合开发项目，在同等情况下给予优先扶持。
　　2、《优势农产品区域布局规划》以外的地区，也要围绕扶持具有地方特色的主导产品和产业安排项目。
　　（三）整合项目
　　1、根据农业综合开发的主要任务，将农业综合开发项目整合为土地治理项目和产业化经营项目两类。从2004年开始，不再单独设立专项科技示范和农业现代化示范项目。同时，整合现有中央农口部门项目，原则上一个部门内只保留1-2类项目，分别纳入土地治理和产业化经营项目范畴。

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