第五十二条 在国家发展和改革委员会确定了年度中央水利基本建设投资规模基础上，水利部根据流域机构和省级水行政主管部门报送的建议计划以及流域机构审核意见，编制中央年度水利基本建设投资计划，报送国家发展和改革委员会。凡列入中央年度投资计划的项目，必须具备以下条件：
1、批复的初步设计；
2、流域机构或省级水行政主管部门上报的年度建议计划，或对于具体项目提出的当年申请中央投资补助的请示报告；
3、应急项目要有批复的应急可行性研究报告或年度应急初步设计（或实施方案）；
4、符合中央投资事权范围。
第五十三条 中央项目水利基本建设投资计划由国家发展和改革委员会下达到水利部；地方项目由国家发展和改革委员会与水利部联合下达各省计划和水行政主管部门，抄送各流域机构。
第五十四条 水利部根据工程进度、地方配套资金落实情况等，将中央项目投资计划按项目下达到流域机构、部直属单位或项目法人，同时抄国家发展和改革委员会备案。水利部下达流域机构的年度投资计划，由流域机构按项目下达到项目法人，其中需要按单项工程下达的，由流域机构分解下达，下达的年度投资计划文件报水利部备案。
第五十五条 流域机构、各省计划和水行政主管部门接到中央投资计划后，要尽可能减少中央投资计划下达层次和环节。中央下达的资金，要按批准的设计方案、建设标准、工程规模和施工定额使用，做到专款专用，不得以任何名义滞留、克扣和挪用。
第五十六条 根据下达的中央年度投资计划，流域机构、省级水行政主管部门和项目法人要组织编制大中型项目和省际边界项目年度工程实施计划，报主管部门批准。中央项目和省际边界项目年度实施计划报水利部或流域机构审批，中央参与投资地方项目的年度工程实施计划报流域机构审批。
第五十七条 项目年度工程实施计划要严格按照批复的初步设计建设方案和建设标准编制，不符合初步设计建设内容和建设标准的年度工程实施计划不予批复。年度工程实施计划批复后，项目法人单位应据此认真组织实施。年度工程实施计划需要调整的，按原审批渠道，由原审批部门调整。
第五十八条 部直属机构科研教育、基础设施建设等基本建设项目计划管理按照水利部《部属单位基础设施建设投资计划管理暂行办法》实施。
第五十九条 水利基本建设项目年度投资计划因各种原因不能按计划执行而需要调整的，由项目主管部门及时提出调整意见，报原下达投资计划的部门进行审核批准，并报上级有关部门备案。
