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（一）统筹规划。农产品质量安全检验检测体系建设的指导思想是，以全面提高农产品质量安全水平为核心，以法律、法规和技术标准为依据，以科学、合理的布局为前提，以完善检验检测手段，提升检验检测能力和技术水平为重点，建立健全体系，以满足农产品生产全过程监管需要。
近期目标是力争用5年左右的时间，初步建立起一套由部、省、县三级组成、布局合理、职能明确、专业齐全、运行高效、既符合我国国情又与国际接轨的农产品质量安全检验检测体系。
在规划布局上，要突出健全和提高部级专业性（包括区域性）农产品质量安全监督检验测试中心（以下简称部级专业性质检中心），建立和完善省（区、市）综合性农产品质量安全监督检验测试中心（以下简称省级综合性质检中心）。同时，合理规划和建设县（市）级综合性农产品质量安全检测站（以下简称县级综合性检测站），鼓励有条件的农产品生产基地和批发市场建立以速测为主的检测站（点），作为县级综合性检测站检验能力的有效补充。
在监测能力上，农产品质量安全检验检测体系要能够满足有关国家标准、行业标准对农产品质量、安 全、工艺、性能参数的检验检测需要，实现对农产品从“农业投入品到批发市场”全程质量安全检验检测。部级专业性质检中心应达到国际同类检验检测机构水平，逐步实现国际双边或多边认可。
（二）充分利用现有资源。农产品质量安全检验检测体系的建设，应当充分利用现有的检测力量和资源，采取填平补齐和完善功能的办法进行科学规划，防止和杜绝重复建设，避免资源浪费。部级专业性质检中心，由农业部按照专业类别、产品种类和优势区域，依托全国农业技术推广、科研教学、分析测试等技术单位现有检测力量进行规划建设；省级综合性质检中心，由各省（区、市）农业（畜牧、渔业等）行政主管部门依托本省（区、市）农业（畜牧、渔业等）系统现有检测中心（站、所）的检测力量和工作基础进行规划建设。检验检测参数指标、仪器设备和专业技术要求相近的，鼓励实行资源整合和共享，合理进行检验检测分工。原则上每个省（区、市）应建设成为一个综合性的农产品质量安全检测中心。由于行政隶属关系或专业特性不便进行整合的，可继续按照行政隶属或专业设立、完善相应的质检中心（站、所），但要做到任务明确、分工清晰，以充分发挥其专业特长和职能作用，防止在规划建设过程中出现大的波动；地市级农产品质量安全检测机构，可作为省级综合性质检中心的区域性（或专业性，下同）分支机构，以补充省级综合性质检中心在区位、专业等方面的检测能力，具体的规划和建设由省级农业（畜牧、渔业等）行政主管部门商地市人民政府确定；县级综合性检测站，应当围绕当地的主导产业和产品，依托农业技术推广体系现有的检测力量和工作基础进行规划建设，农产品生产基地和批发市场检测站（点），应当突出速测和自检。
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