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（2）开展食品中生物污染物监测与评价。在全国建立致病菌及真菌毒素的监测网络，对重点食品实施主要食源性致病菌和真菌毒素污染状况的主动监测，及时发现潜在的和正在发生的食品中生物性污染问题，进行危险性评价，用于制定相关的政策法规，指导食品卫生监督工作，引导食品生产和消费。
（3）开展总膳食研究。通过对中国居民的总膳食研究，获得我国主要和特定污染物的实际膳食摄入量，通过与安全摄入量比较评价我国居民膳食安全水平，为国家制（修）定食品卫生标准提供重要依据。
（4）进行化学和生物污染物的连续和主动监测。开展污染源的追踪调查，利用网络技术平台和相应微机软件，系统分析全国食品污染物的污染水平和动态变化，从而提出食品污染物危险性管理的重点及防治措施。建立食品污染的预警和快速反应系统。
3、指标
（1）污染物监测点建设：在现有污染物监测网的基础上，2004年在12个省（自治区、直辖市）建立40－50个监测点；2005年在15个省（自治区、直辖市）建立50－60个监测点；2006年在18个省（自治区、直辖市）建立60－80个监测点；2007年在27个省（自治区、直辖市）建立140－150个监测点；2008年在31个省（自治区、直辖市）建立180－200个监测点。
（2）实验室能力建设
─2004－2005年，化学污染物监测国家级中心实验室通过WHO的核心监测项目分析质量保证（AQA）考核，12个省级实验室要达到WHO的全球环境污染监测规划/食品部分（GEMS/Food）规定的核心监测项目名单要求，并通过国家中心实验室的AQA考核。其中，5－8个实验室选择性开展15种常用兽药残留（克仑特罗、抗生素等）或氯丙醇监测。
在生物污染物监测方面，国家级中心实验室通过WHO的室间质量控制考核（EQAS）。
─2006－2007年，化学污染物监测有20个省级实验室达到GEMS/Food规定的核心监测项目名单要求， 12个省级实验室达到GEMS/Food规定的中级监测名单要求；其中，10个实验室选择性开展氯丙醇或兽药残留或60种以上农药残留的监测。2－3个监测点实验室能选择性开展鱼、蛋、奶中二恶英和多氯联苯监测或油炸食品中丙烯酰胺监测。5个实验室有能力通过WHO的AQA考核。
生物污染物监测方面，有12－20个监测点实验室通过国家中心实验室的EQAS考核。
─2008年，化学污染物监测有30个省级实验室达到GEMS/Food规定的核心监测项目名单要求，20个省级实验室达到GEMS/Food规定的中级监测名单要求，10个省级实验室达到GEMS/Food规定的全面监测名单（包括多氯联苯或二恶英和硝酸盐/亚硝酸盐的监测）要求，6个实验室通过WHO的AQA考核。10－12个实验室选择性开展兽药残留、农药残留、氯丙醇、多核芳烃或丙烯酰胺监测。20个监测点能够监测100种以上农药残留。
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