根据土地利用总体规划和《
基本农田保护区调整划定工作验收办法》（国土资发[2000]126号），检查基本农田是否落实到图上、地块、村组和农户，面积和区位是否符合规划要求；是否逐级签定了基本农田保护责任书，落实了基本农田保护责任；是否做到图、表与地块相符，档案齐备，县、市、省三级备案；是否按要求设立基本农田保护标志，填报《基本农田基础性工作落实情况汇总表》（表一）。
（二）基本农田利用和变化情况
主要检查各地基本农田保护区划定后的变化情况。根据实地检查情况，以及现有综合统计数据、土地变更调查数据、土地利用总体规划修改和建设用地审批等情况填报《基本农田利用及变化情况汇总表》（表二）、《非农建设占用基本农田情况汇总表》（表三）、《基本农田质量情况汇总表》（表四），并填报检查表（表五、六、七）。
1、基本农田的利用现状：划定和补划的基本农田保护区内的现有耕地，以及林地、园地、鱼塘等非耕地的农用地地类面积。
2、基本农田减少和补划情况：基本农田保护区划定后非农建设占用基本农田的批准占用情况、通过修改土地利用规划实际占用情况、未经依法批准占用情况；发展林木、挖鱼塘、畜牧养殖以及生态环境建设中占用基本农田的具体情况；其他违反法律规定占用和破坏基本农田情况；补划基本农田的面积、地类等。
3、基本农田质量状况：不同地力等级的基本农田面积及地力变化情况；补划的基本农田是否做到与占用的耕地质量相当；基本农田的质量建设投入情况。
（三）基本农田保护制度建立与执行情况
主要检查各地是否建立了基本农田各项管理制度，制度执行情况及工作中存在的问题及原因；违反基本农田保护制度，特别是违反《
关于进一步采取措施落实严格保护耕地制度的通知》提出的“五不准”的有关情况。要着重检查基本农田监管措施及落实情况；对违反法律规定占用和破坏基本农田的处理情况；以及基本农田保护区地力建设和监测制度及措施，基本农田污染监测制度建立和执行情况。
三、方法步骤
（一）组织领导
国土资源部和农业部成立基本农田保护检查工作领导小组，领导小组下设办公室，负责组织协调工作。（见附件）
基本农田保护检查工作要在地方各级政府统一领导下，争取政府主管领导挂帅，由国土资源部门与农业行政主管部门会同有关部门成立基本农田保护检查工作领导小组和办公室组织实施，做到工作方案和计划周密，专项经费落实。
