2005年，进一步巩固前两年的治污工作，加强对重点企业、入湖河道、入河排污口水质水量监测，加强船舶污染防治，开展节水，全面实现《巢湖计划》目标。
五、实施要求
巢湖流域治污的关键是有效控制生活污水排放、削减面源、清除内源。主要包括沿湖区合肥市、巢湖市、柘皋等城镇污水处理厂建设，流域内农药、化肥使用量的削减，水土流失的控制，巢湖东、西半湖区底泥清淤工程的实施。
(一)生态环境建设
主要包括流域内生态林业工程建设；削减化肥、农药使用量，提高利用率，扩大有机肥使用量，巢湖湖周5公里范围内限制农药、化肥的使用；科学安排流域内土地资源开发利用，依法严格审批沿湖地区土地利用与开发；加大巢湖水体的水量交换，加快“引江济淮”工程前期工作进度。
(二)水污染防治
水污染防治措施主要包括：1、加快合肥市、巢湖市、肥东县(店埠)、肥西县(上派)等城镇污水处理厂建设，提高污水处理率，采用具有除磷脱氮工艺的二级或二级强化处理工艺；加快农村改水、改厕工程进度，强化乡镇生活污水处理设施建设，城市垃圾基本得到无害化处置，乡镇垃圾因地制宜处置。2、加大工业污染源(含集约化畜禽养殖场)达标排放的督查。结合产业结构调整，在食品、塑料制品、非金属矿物制品、纺织、农用化工、日用化工等行业，改造提高传统产业，有重点地培育高新技术产业。积极推广清洁生产工艺，从源头上减少污染，提高资源利用率。3、大力开展节水工作，研究有利于节水的经济政策，调动全社会节水的积极性。4、加强巢湖流域船舶污染防治。城市垃圾和污水系统的建设，一并考虑船舶废弃物和污水接收处理设施的建设，保证船舶固体废弃物和生活污水集中上岸处理。5、实施全部湖岸崩塌地段整治工程；实施巢湖东、西半湖区底泥清淤工程。
(三)监测和科研
巢湖流域109家重点排污企业安装在线监控仪。巢湖湖区及主要支流入湖河排污口每年进行1-2次污染物排放量实测。湖区饮用水源地及重要支流建设水质自动监测站，跟踪水质变化情况。开展巢湖流域畜禽养殖业及三产排污状况调查。对巢湖湖区及主要支流水环境容量、面源污染状况及污染物迁移规律等进行研究，提出科学的水污染防治对策。
六、资金来源
“十五”期间，巢湖流域水污染防治计划实施项目49个，项目计划投资48.7亿元。流域水污染防治资金由地方负责筹集，国家适当给予支持。安徽省要建立污水和垃圾处理收费机制，加大污水和垃圾处理费的征收力度，逐步提高污水和垃圾处理费收费标准，推进污水、垃圾处理产业化，增强水污染治理项目的融资能力，吸引社会资金投向水污染治理项目。根据“谁污染，谁治理”的原则，工业企业的治理资金以企业自筹为主。工业企业要努力拓宽融资渠道，积极争取银行贷款、民间资本和国外资金等，保证资金落实到位。
