（三）农产品收购发票
1、审核收购发票填写是否规范，项目是否填写齐全；
2、审核其经营范围与其收购发票填写项目是否具有相关性，收购数量与其经营能力是否配比等；
3、要求纳税人提供及运费结算单据、入库单等相关单证。
四、复审复查环节内容及具体要求
在申报期结束后，税源管理部门应对纳税人当月增值税其他抵扣凭证申报抵扣税款情况进行综合分析，要充分应用“两个系统”的数据分析功能，结合“销售额变动率”、“成本毛利率”、“进销项税额变动”等指标，对纳税人申报抵扣税款信息进行综合分析，对纳税人偶然发生的、非货物主产地纳税人同一时间开具的大量相同或者类似数额的增值税抵扣凭证的、纳税人货物购进地和销售地均不在本地区以及纳税人申报税负明显低于同行业平均税负的，要对其进行重点审核。具体为：
（一）货运发票
使用运费发票抵扣税款的，对于大额抵扣发票、外地运费发票、抵扣占比过高的企业和凭证要重点进行核实，要重点分析货物起运地、运达地、发票开具地等相关信息，对大额货运发票以及取得货运发票载明货物起运地或者运达地与发票开具地不一致的，应要求纳税人提供承运货物合同、相关证明依据等；
（二）海关进口增值税专用缴款书
对申报抵扣海关进口增值税专用缴款书的企业，要根据其税负率、经营项目、资金往来等情况进行分析，看是否存在疑点，对其库存等情况进行实地核实，对于单笔税额较大的、双抬头的以及海关进口增值税专用缴款书进项占比过高的要重点核实。
（三）农产品收购发票
对申报抵扣农业产品收购发票的企业，要对税负率、农产品收购价格、收购金额和收购对象、农产品耗用量、销售毛利率、资金往来等情况进行重点审核，对其购进渠道进行落实，检查其是否存在农业产品收购发票违规开具问题；对大宗农产品收购业务，可根据需要审核是否有按规定报验，实地查验登记簿记录是否完整等情况。
五、对辅导期一般纳税人，受理纳税申报时，要重点对纳税人申报抵扣的比对结果信息进行汇总审核，只有取得比对结果的方予抵扣。
六、各单位要严格抵扣凭证审核监督流程，切实强化对其它抵扣凭证审核的管理监督。对日常审核及复审复查过程中发现的纳税人申报抵扣不规范及虚抵进项嫌疑，要及时通过约谈、评估等方式进行处理，对发现有重大偷税嫌疑的，要及时移交稽查部门予以查处。
