开展疫情调查时尚在医院就诊的病例，由医院负责标本采集，其他病例及密接由疾控中心负责。
（五）病毒分离
北京市疾控中心每月开展上送病例标本的实验室检测及病毒分离工作，怀柔、宣武、西城区对本辖区所有检测阳性的标本（含监测病例、聚集性病例、暴发疫情、住院、重症及死亡病例等）开展病毒分离工作，每月至少上送2株毒株到市CDC。
（六）标本上送
各区县在每月的前5个工作日内，将上月所有未分型标本、混合感染阳性标本、重症和死亡病例中的阳性标本，以及每起暴发疫情的1件阳性标本上送市CDC，要求每件标本量不少于1.0ml。
每月各区县将采集到的血清标本送市CDC。
五、疫情控制
（一）住院、重症及死亡病例
每个病例均需开展流行病学调查，并填写《手足口病重症或死亡病例个案调查表》，调查结束后录入统一数据库。
报告和收治住院、重症及死亡病例的医院必须全力配合病例属地疾控中心的流调，并承担采样工作。
（二）聚集性病例和暴发疫情
对所有病例开展流行病学调查，填写《手足口病个案调查表》。
出现重症或死亡病例，或1周内同一班级出现2例及以上病例，建议病例所在班级停课10天；1周内累计出现10例及以上或3个班级分别出现2例及以上病例时，经风险评估后，可建议托幼机构停课10天。
报告病例的医疗单位必须全力配合病例属地疾控中心流调，并承担采样工作。
六、报表填写
所有采集标本的病例，包括监测病例、重症或死亡病例、聚集性病例和暴发疫情中采集标本的病例，除血清外均送本区县疾控中心检测，检测结果填入附表1，每周一通过OA报告至市疾控中心传地所肠道组（如本周未采样，可不报告）。血清标本填写附表1后，送至市CDC转送国家CDC检测。
所有聚集性病例和暴发疫情均需填写附表1、附表2、附表3，每周一通过OA报告至市疾控中心传地所肠道组（如本周未采样，可不报告）。
附表：1.手足口病病原学监测报表
2.手足口病聚集性病例个案报表
3.手足口病聚集性病例汇总表
附表1：
手足口病病原学监测报表
编号
| 区县
| 医院
| 姓名
| 性别
| 年龄
| 职业
| 病例性质
| 发病日期
| 诊断日期
| 采样日期
| 检测日期
| 临床症状（划勾）
| 标本类型（划勾）
| 实验结果（划勾）
|
RT-PCR
| Realtime-RT-PCR
| 病毒分离
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发热
| 疱疹
| 肺炎
| 脑炎
| 其他
| 便
| 咽拭子
| 疱疹液
| 血
| 尸检标本
| 其它
| HEV 71
| CVA 16
| 其他HEV
| HEV 71
| CVA 16
| 其他HEV
| RD
| HEp-2
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