1、市政府办公厅负责牵头协调理顺保税港区和福清市在投资、收益方面以及保税港区和江阴开发区、保税区等的关系，并提出整合方案上报市政府研究。市财政局、福清市政府、福州保税区管委会配合。
2、市发改委负责牵头编制《福州保税港区开发建设方案》、《福州保税港区总体规划》和《福州保税港区管理办法》上报市政府研究。福州海关、市政府法制办、福清市政府、福州保税区管委会配合。
3、市外经贸局负责牵头加快推进福州保税港区招商工作。福清市政府、福州保税区管委会配合。
4、市港口管理局负责加快促进外贸集装箱航线转移福州新港工作。福州港务集团配合。
5、福州海关、福建检验检疫局负责依据《海关特殊监管区域基础和监管设施验收标准》，提出福州保税港区监管设施和口岸查验信息化平台等建设方案；负责提出福州保税港区内海关、检验检疫查验机构整合方案并尽快向上申报机构编制。
6、福州保税区管委会具体负责福州保税港区开发建设和行政管理的日常工作；负责拟定福州保税港区有关具体政策上报市政府研究。
三、时间安排
福州保税港区一期验收时间安排在2010年12月30日前。为确保顺利通过正式验收，一期建设有关工作以此为基准进行倒计时安排。
1、港口内外贸货物监管方案及相关监管设施。7月份，由福州保税区管委会与海关共同商定，征求港区业主意见，拟定港区内外贸货物分流管理实施方案；8月份完成项目现场勘测、设计和图审等工作；完成造价编制、招标代理单位选择及财审工作。9-10月份，公开招标选定施工和工程监理单位，并组织海关围网及相关监管设施建设。
2、海关监管信息化平台。7月份，拟定海关监管信息化平台方案，并选定项目承接单位。8月份，由承包单位负责草拟监管信息化平台建设方案，并提交海关审核确认。9-10月份，完成海关监管信息化平台建设。
3、福清出口加工区一期道路管网和海关巡视道。7月份，完成项目地质勘探、设计和图审以及编制工程造价。8月份，完成项目造价财审、公开招标选择施工监理单位和公开招标选择施工单位。9-11月份，完成改道路管网和海关巡逻道施工。
4、福州保税港区总平规划。7月份，完成前期资料收集及确定招投标方案。8月份，完成项目招投标工作。9月-10月份，完成总平规划编制。
