滨湖区政府：负责制定并组织实施本辖区内太湖（蠡湖）新城“清水流域”建设实施方案。
　　南长区政府：负责制定并组织实施本辖区内太湖（蠡湖）新城“清水流域”建设实施方案。
　　新区管委会：负责制定并组织实施本辖区内太湖（蠡湖）新城“清水流域”建设实施方案。
　　太湖城管委会：负责制定并组织实施本辖区内太湖（蠡湖）新城“清水流域”建设实施方案。
　　市发改委：负责有关建设项目的立项审批工作；做好向上争取工作，负责将有关建设项目列入“十二五”规划和各类专项规划，争取国家和省的政策和资金支持。
　　市财政局：负责制定并落实资金保障方案，由市相关部门实施的项目，市财政要设立专项资金，做好国家、省相关专项资金争取工作。
　　市建设局：负责制定农村生活污水治理实施方案，督促和指导各地区农村生活污水治理工作。
　　市交通运输局：负责制定并组织实施航道限航禁航方案，做好太湖（蠡湖）新城范围内河道全面停航工作。
　　市水利局：负责制定水系优化、引流活水和河道整治实施方案，督促和指导各地区水系优化、引流活水和河道整治工作，负责骨干河道和跨区域河道的项目可研和初步设计。
　　市农委：负责制定湿地修复和绿化工程实施方案，督促和指导各地区湿地修复和绿化工程建设工作，负责梁塘河湿地的项目可研和初步设计。
　　市环保局：负责制定并组织实施点源污染治理实施方案，制定太湖（蠡湖）新城水质监测方案。
　　市太湖办：负责太湖（蠡湖）新城“清水流域”建设工作领导小组办公室和联席会议办公室的日常工作，负责制定并组织实施蠡湖生态修复实施方案。
　　市规划局：负责做好有关“清水流域”建设项目的规划审批工作。
　　市市政园林局：负责制定并实施排水达标区方案，指导市市政公用产业集团和市园管中心做好安全供水、中水回用以及太湖博览园水环境综合整治工作。
　　市经信委：负责制定并组织实施22家重点企业清洁生产方案。
　　市监察局：负责对市有关地区和部门的“清水流域”建设实施情况进行监督检查，对履行职责不力的有关部门、责任单位和责任人员进行责任追究。
　　市园管中心：负责中国太湖博览园、蠡湖及周边地区内水环境综合整治工作。
　　市市政公用产业集团：负责制定并组织实施安全供水、水资源利用（中水回用）实施方案。
　　（三）规范项目管理
　　按照“高标准规划，高效率管理”的要求，编制《太湖（蠡湖）新城“清水流域”建设规划》，科学谋划“清水流域”建设项目列入规划，并使之与地区发展规划和行业专项规划相衔接。优化项目结构，深化前期工作，强化投资项目的针对性、前瞻性和可持续性，提高投资决策的科学性、民主性。各地区、各部门要把有关“清水流域”建设项目列入年度投资计划和工作安排，作为示范项目重点规划建设。科学化、规范化、制度化，高效率地管理投资项目，把“清水流域”建设工程打造成太湖流域性综合建设的示范和典范。

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